清雍正年间，少林寺接连出现离奇命案，数名弟子神秘死亡，少林三十六代和三十七代掌门也相继被害，康熙御赐的墨玉香炉被盗，所有疑点都指向俗家弟子雷鹏飞（黄家达）。雍正帝（江南）欲借题发挥，命玉格格（龙君儿）前往少林逼少林交出盗宝者，现任掌门圆慧（鲁平）只得答应若限期内查不出凶手就焚寺自尽。雷鹏飞在师祖田智（张翼）和女俗家弟子…

清初，前明王子朱棣襖（江彬）在少林弟子和民间侠士的护送下准备与旧部汇合企图复国，清廷派出某贝勒沿途追杀，投靠了清廷的江湖杀手血里飘（张翼）是少林叛徒，他有一身好武功，使用的独门暗器“血里飘”更能杀人于无形，最后正邪双方在少林寺进行了决战……